Бактериологические лаборатории являются неотъемлемой частью многих лечебно-профилактических учреждений (клинические больницы общего типа, больницы скорой помощи, инфекционные больницы, специализированные больницы и т. п.). Бактериологическая лаборатория выполняет исследования по выявлению микроорганизмов в биологическом материале и определению их чувствительности к антибиотикам (антимикотикам, бактериофагам) классическим микробиологическим методом. Суть метода заключается в посеве материала на питательные среды, регистрации роста культуры с последующей идентификацией до рода и вида. Кроме диагностических задач, позволяющим лечащим врачам выявить возбудителя и рационально подобрать антимикробную терапию, бактериологические лаборатории выполняют важную функцию по предотвращению и распространению инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, а также осуществляют санитарно-бактериологический контроль объектов окружающей среды, медицинских инструментов, одежды и рук медицинского персонала ЛПУ. В некоторых ЛПУ в состав бактериологической лаборатории включают подразделения, выполняющие анализы на детекцию возбудителей серологическими, иммуноферментными и ПЦР методами.

К сожалению, во многих проектах информатизации при установке медицинских и лабораторных информационных систем бактериологическим лабораториям уделяется внимание по остаточному принципу. В результате в лучшем случае информатизация бактериологической лаборатории сводится к тому, что данные по выполненным исследованиям вносятся вручную по завершению анализов, в худшем – бактериологическая лаборатория остается вне контекста общебольничной информатизации, продолжая работать “на бумаге” или выдавать результаты из имеющихся в лаборатории приборов без фиксации их в единой информационной системе ЛПУ.

Низкая степень информатизации бактериологических лабораторий обусловлена следующими причинами:

■ Сложность лабораторного процесса бактериологической лаборатории. Выполнение бактериологических исследований растянуто во времени, требует большого количества ручных манипуляций даже при наличии анализаторов.

■ Низкая степень автоматизации процесса исследований. В отличие от КДЛ (так называемой “зоны сыворотки”) в бактериологических лабораториях отсутствуют полностью автоматические анализаторы, позволяющие поставить на борт пробирку с биоматериалом и через некоторое время получить результат.

■ Специализированное оборудование. В бактериологических лабораториях используется оборудование, значительно отличающееся по способу взаимодействия и интеграции с информационными системами от оборудования, используемого в “сывороточной зоне”.

■ Необходимость экспертной оценки результатов. В процессе бактериологического исследования может проводиться множество тестов (биохимических, микроскопических и т. п.), но результаты этих тестов по сути не имеют значения для лечащего врача и остаются в лаборатории. Вместо этого на основании проведенных исследований лаборатория должна оценить этиологическую роль каждого выделенного микроорганизма, его количества в полученном биоматериале, выдать экспертное заключение о чувствительности к антибиотикам и выявленных механизмах резистентности.

Таким образом, многие поставщики информационных систем вместо глубокой проработки предметной области и процессов бактериологических лабораторий предпочитают обходить их стороной, ссылаясь на то, что в них “все равно работают вручную” и информатизация им якобы не нужна.

В лабораторном процессе традиционно выделяют преаналитический, аналитический и постаналитический этапы (Рис. 1).

На преаналитическом этапе происходит:

■ Забор биоматериала;

■ Маркировка биоматериала;

■ Регистрация биоматериала в лаборатории;

■ Приготовление питательных сред.

На аналитическом этапе выполняется:

■ Определение степени обсемененности биологических жидкостей;

■ Посев биоматериала на питательные среды;

■ Анализ роста выделенных микроорганизмов;

■ Выделение чистой культуры;

■ Идентификация микроорганизма (вручную, на бактериологическом анализаторе или на масс-спектрометре);

■ Определение чувствительности к антибиотикам и другим препаратам (на бактериологическом анализаторе, либо диско-диффузионным методом с регистрацией зон задержки роста вручную или на анализаторе антибиотикограмм);

■ Экспертная оценка и формирование заключения.

На постаналитическом этапе осуществляется:

■ Выдача результата исследования;

■ Передача результатов в электронную историю болезни;

■ Передача данных в специализированные и мониторинговые программы;

■ Построение отчетов (количество выполненных исследований, высеваемость, чувствительность выявленных микроорганизмов к различным препаратам в разрезе отделений и т. п.).

Задачи информатизации бактериологических лабораторий

Внедрение информационной системы, в полной мере учитывающей перечисленные особенности бактериологических лабораторий, позволяет достичь основных задач информатизации, таких как:

■ Избавление от бумажного документооборота в процессе проведения бактериологических исследований;

■ Уменьшение ошибок человеческого фактора;

■ Повышение качества результатов;

■ Увеличение скорости получения анализов лечащим врачом;

■ Мгновенное получение разнообразных отчетов и аналитики;

■ Включение в общий контур информатизации ЛПУ.

ЛИС “АльфаЛАБ” полностью адаптирована к требованиям и особенностям бактериологической лаборатории. Использование ЛИС “АльфаЛАБ” в бактериологической лаборатории позволяет:

■ Выдавать единый бланк результата по бактериологическому исследованию, включающий информацию по выявленным микроорганизмам, их количеству и чувствительности к препаратам. Бланк результата всегда формируется по единой форме независимо от того, каким методом и на каком анализаторе был получен результат.

■ Вести, отслеживать и контролировать все этапы микробиологического процесса. ЛИС “АльфаЛАБ” хранит не только результат, но и то, каким образом он был получен (на каких средах был рост, каков был характер роста, результаты микроскопии, биохимических тестов

и т. п., каким методом проводилась идентификация и чувствительность и прочее). Это позволяет избавиться от бумажных журналов, в изобилии использующихся в бактериологических лабораториях.

■ Управлять и получать данные со всего оборудования, использующегося в лаборатории, в том числе оборудования разных производителей.

■ Проводить экспертную оценку полученных результатов, выявлять маркеры резистентности, выводить заключения экспертной системы на бланки результатов.

■ Осуществлять выгрузку данных в специализированные и мониторинговые информационные системы (например, WHONET 5.6).

■ В считанные секунды получать сводные отчеты, как общие, так и специфические для бактериологической лаборатории.

■ Интегрировать бактериологическую лабораторию в информационное пространство медицинского учреждения за счет богатых возможностей взаимодействия с медицинскими системами, а также благодаря модулям автоматической рассылки результатов по электронной почте, уведомления врачей по смс и т. п.

Рассмотрим подробнее функции ЛИС “АльфаЛАБ” на разных этапах микробиологического процесса.

Электронное направление может быть сформировано вручную с бумажного направительного бланка, либо получено по защищенным каналам связи в электронном виде (из общей медицинской информационной системы ЛПУ или из рабочего места удаленной регистрации).

При формировании направления указываются данные пациента, данные о его местонахождении (медицинская организация, отделение, врач), состоянии, диагнозе и особенностях лечения, релевантных для проведения анализа. Далее обязательным является выбор исследования и биоматериала, а также указание локализации. При использовании ручной регистрации ввод информации о пациенте может быть ускорен, если пациент уже был в системе, либо за счет подключения ЛИС “АльфаЛАБ” к регистратуре медицинского учреждения.

При поступлении биоматериала в лабораторию производится его маркировка штрих-кодом (если биоматериал не был штрих-кодирован при заборе), активация и маршрутизация по лаборатории в зависимости от вида исследования и биоматериала (воздушно-капельная группа, кишечная группа, клиническая микробиология и т. п.).

ЛИС “АльфаЛАБ” позволяет быстро и удобно регистрировать протоколы на проведение санитарно-бактериологических исследований. Особенностью санитарно-бактериологических исследований является то, что они формируются большими списками (от десяти до ста и более смывов) и относятся не к пациенту, а к предметам окружающей среды, медицинскому инструменту, рукам и одежде медицинского персонала и т. п.

Для посевов мочи возможно подключение к ЛИС “АльфаЛАБ” автоматических анализаторов на бактериурию, таких как SysmexUF-500, ArkrayHybridAU-4050, AlifaxHB&L. В случае выявления обсемененности анализ продолжается классическим методом.

Для посевов крови ЛИС “АльфаЛАБ” позволяет подключить анализаторы крови на стерильность, таких как Bactec 9050, BacT/ALERT 3D, VersaTREK.

После регистрации биоматериала для каждого образца ЛИС “АльфаЛАБ” формирует перечень питательных сред, на которые должен осуществиться посев. Перечень сред формируется автоматически в зависимости от вида исследования, группы исследований и биоматериала. Поддерживается передача задания в роботизированные системы микробиологического посева, такие как WASP, Kiestra, PreviIsola. Также поддерживается ручной посев с маркировкой чашек как уникальным штрих-кодом, так и коротким номером пробы. Благодаря данной возможности становятся доступны отчеты по точному расходованию сред и других материалов.

При считывании штрих-кода чашки с помощью сканера штрих-кодов автоматически открывается рабочая область, относящаяся к соответствующему анализу.

В рабочей области можно внести информацию о росте, характеристиках выросшей колонии, а также зафиксировать прочие параметры (результаты микроскопии, биохимические тесты и т. п.). Фиксируется время ввода данных и информация о сотруднике, осуществившем ввод данных. Таким образом, ЛИС “АльфаЛАБ” сохраняет все параметры микробиологического исследования и позволяет заменить бумажные журналы на электронные (Рис. 2).

ЛИС “АльфаЛАБ” поддерживает ручную идентификацию, идентификацию на масс-спектрометре, бактериологическом анализаторе с использованием коммерческих тест-систем.

ЛИС “АльфаЛАБ” позволяет подключить различные масс-спектрометры, такие как MALDIBiotyper, VitekMS. Из масс-спектрометра передаются кандидаты и их вероятность. Оценка и выбор верного кандидата может осуществляться как в ЛИС “АльфаЛАБ”, так и в специализированном программном обеспечении анализатора.

ЛИС “АльфаЛАБ” поддерживает работу и с классическими микробиологическими анализаторами, такими как WalkAway, AutoScan, Vitek 2,

Phoenix, BiomicV3. Взаимодействие осуществляется в двустороннем режиме. ЛИС передает необходимые данные в программное обеспечение анализатора и получает назад выявленные микроорганизмы и их чувствительность.

При определении чувствительности к антибиотикам ЛИС “АльфаЛАБ” позволяет подключить анализаторы антибиотикограмм, такие как Bio-RadAdagio, GilesBiomicV3, также ЛИС “АльфаЛАБ” поддерживает ручные методы, основанные на методе последовательных разведений и диско-диффузионном методе. ЛИС “АльфаЛАБ” позволяет ввести либо значение минимальной подавляющей концентрации, либо диаметр зоны задержки роста и автоматически с помощью встроенной экспертной системы получить значение чувствительности, основываясь на клинических рекомендациях по определению чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам (ноябрь, 2014 г., основаны в свою очередь на EUCAST).

Встроенная экспертная система ЛИС “АльфаЛАБ” основана на базе модуля экспертной системы из широко распространенной программы “Система микробиологического мониторинга Микроб-2”.

После выявления микроорганизмов и получения чувствительности к антимикробным препаратам ЛИС “АльфаЛАБ” позволяет провести экспертную оценку. Встроенная экспертная система выдает заключения следующих видов:

■ Предупреждения, на которые следует обратить внимание врачу-бактериологу. Предупреждения такого рода могут означать, что на каком-то этапе произошла ошибка (например, был получен результат “чувствителен” для микроорганизма, обладающего природной резистентностью

к данному препарату);

■ Информационные сообщения, которые могут быть полезны лечащему врачу и должны быть выведены на печать в бланке результатов;

■ Маркеры резистентности, дающие дополнительную характеристику выявленных микроорганизмов.

Таким образом, ЛИС “АльфаЛАБ” аккумулирует все результаты в единое хранилище, независимо от того на каком этапе и на каком оборудовании они были получены. После получения данных с анализаторов и проведения экспертной оценки результаты утверждаются врачом, после чего они становятся доступны для выдачи в качестве результатов.

ЛИС “АльфаЛАБ” позволяет сформировать стандартный бланк с результатами микробиологического исследования. Бланк результата имеет единую форму (настраиваемую по требованиям лаборатории), которая не зависит от того, на каком оборудовании и каким методом выполнялись те или иные этапы исследования. Бланк результата, как правило, содержит информацию о лаборатории и медицинском учреждении, данные пациента, дату заказа, дату взятия биоматериала, дату получения биоматериала в лаборатории, наличие/отсутствие роста, выделенные микроорганизмы и их чувствительность к препаратам, заключения экспертной системы в удобном для лечащего врача виде. Выводится также дата выполнения результата, данные врача, утвердившего результат. Возможен также вывод факсимиле подписи врача и печати организации.

Благодаря богатой функциональности ЛИС “АльфаЛАБ”, есть возможность пакетной печати результатов (с группировкой по отделениям и врачам), отправки результатов в электронном виде, уведомления врачей и пациентов о готовности по смс, получения результатов через рабочее место удаленного доступа. Также поддерживаются различные протоколы интеграции с медицинскими информационными системами (включая HL7) для передачи результатов в электронную историю болезни.

Ранее выданные результаты сохраняются в надежный электронный архив. Таким образом, результат любого пациента можно выдать повторно. Архивные результаты доступны для печати в любое время, несмотря на модернизацию лаборатории, замену оборудования и т. п. (Рис. 3).

При выполнении санитарно-бактериологических исследований может быть распечатан единый протокол с результатами всех проведенных исследований.

Модуль отчетов ЛИС “АльфаЛАБ” позволяет получить любые отчеты, которые требуются пользователям. Поддерживаются как общие отчеты (например, по количеству исследований, годовой отчет и другие), так и специализированные отчеты для бактериологических лабораторий (например, количество исследований, высеваемость с разбивкой по микроорганизмам и другие). Модуль отчетов ЛИС “АльфаЛАБ” имеет возможность расширения. Если какой-то вид отчета, требуемый в лаборатории, не предусмотрен изначально, он может быть добавлен на этапе установки и настройки системы.

При использовании в лаборатории специализированных и мониторинговых программ (например, WHONET 5.6), результаты могут быть переданы в них в автоматическом режиме.

Таким образом, ЛИС “АльфаЛАБ” поддерживает ключевые особенности бактериологических лабораторий, берет на себя роль центрального звена автоматизации современной бактериологической лаборатории, учитывает все аспекты микробиологического процесса, включая ручные манипуляции, позволяет взаимодействовать с различным оборудованием, используемым в лаборатории, имеет встроенную экспертную систему, соответствующую действующим стандартам, консолидирует всю необходимую информацию по проведению исследований и их результатах, что позволяет исключить ненужные бумажные артефакты и добиться прослеживаемости процесса и качества результатов, а также получать достоверные статистические и эпидемиологические отчеты.